Hugues Berry est directeur de recherches à l’Inria (Institut national de recherche en informatique et automatique) à Lyon. Il a obtenu un doctorat en biochimie/biophysique de l’Université de technologie de Compiègne en 1999, puis fut maître de conférences au sein du département Biologie de l’Université de Cergy-Pontoise de 2000 à 2004. En 2004, son activité de modélisation et de simulation numérique l’amena à rejoindre l’Inria, d’abord au sein de l’équipe-projet Alchemy à Osay (où il a contribué à un projet d’informatique bio-inspirée) puis, depuis 2009, dans l’équipe-projet Beagle sur la modélisation en biologie cellulaire et évolution. Ses thématiques de recherche concernent la biologie cellulaire computationnelle et les neurosciences computationnelles. Plus spécifiquement, il s’intéresse actuellement à l’influence de l’espace et l’encombrement macromoléculaire sur la signalisation et la biochimie intracellulaire, et aux réseaux moléculaires impliqués dans la plasticité neuronale et les interactions entre cellules gliales et neurones.
Modèles analogiques, modèles mathématiques, multimodélisations, simulations numériques, simulations à base d’objets ou à base d’agents, simulations hybrides, simulations multi-échelles, multi-aspects ou multi-physiques… Cet ouvrage entreprend de faire le point sur la variété des techniques contemporaines de modélisation et de simulation en sciences. Le...
Ces dernières années, les débats à propos des notions de sexe et de genre entre biologie et sciences humaines et sociales connaissent une intensité accrue, tant pour des raisons scientifiques que pour l’effet que ces positions ont sur les usages sociétaux de ces notions. Beaucoup de biologistes rejettent la mise en cause par une partie des sciences...
Le vivant critique et chaotique fut le titre de l’école de printemps 2014 de la Société francophone de biologie théorique (SFBT) qui a eu pour motivation d’attirer plus particulièrement la communauté des physiciens, avec pour argumentaire de « transposer les outils d’analyse des systèmes dynamiques hors équilibre, transitoires, critiques et chaotiques...
Le Vivant discret et continu propose un ensemble de quatorze cours donnés à l’occasion de l’école de printemps 2012 de la Société francophone de biologie théorique, laquelle a porté sur le thème de l’expérimentation numérique et des systèmes hybrides comme alternatives efficaces aux approches mathématiques « classiques » dans la compréhension du...