Analyse des réseaux sociaux appliquée à l’éthologie et l’écologie

Avant-propos, Cédric Sueur (page 5)

Introduction, Cédric Sueur (page 7)

Chapitre 1 (page 21), Cédric Sueur, Sebastian Sosa & Nicolas Perony, De l’utilité de l’analyse des réseaux sociaux dans l’étude du comportement animal

1] Définition d’un réseau social

2] Propriétés globales d’un réseau social

3] Caractéristiques intrinsèques aux données issues du comportement animal et méthodes analytiques

4] Logiciels utilisés en analyses des réseaux sociaux

5] Mesurer les attributs et rôles des individus

6] Entre l’individu et le groupe  : mesures intermédiaires ou de communauté

7] Propriétés de la structure sociale à l’échelle du groupe

8] Comparer les réseaux

9] Conclusion

Chapitre 2 (page 49), François Massol, Franck Jabot, Stéphanie Manel, François Munoz, Etude des réseaux en écologie

1] Définitions, concepts et historique

1.1] Métapopulations et concepts associés

1.2] Ecologie du paysage

1.3] Les réseaux d’interaction

1.4] Propriétés topologiques des réseaux

2] Pourquoi s’intéresser aux réseaux en écologie ?

2.1] Origine et maintien de la diversité biologique

2.2] Dynamiques des systèmes écologiques

2.3] Complexité des réseaux d’interaction

2.4] Fonctionnement des écosystèmes

2.5] Distribution géographique des espèces

3] Les réseaux de contact

3.1] Réseaux de contact en épidémiologie

3.2] Dynamique de la biodiversité sur un réseau de contact

3.2.1] Connectivité de populations et de communautés dans un paysage hétérogène

3.2.2] Dynamique de réseaux de populations et de communautés

4] Les réseaux trophiques et autres réseaux multipartites

4.1] Modélisation des réseaux trophiques et des réseaux d’interaction

4.2] Méthodes empiriques pour l’étude des réseaux trophiques

4.3] Utilisation des réseaux bipartites et multipartites en écologie spatiale

Chapitre 3 (page 99), Yann Tremblay, Camille Assali, Andréa Thiebault, Raphaël Jeanson, Utilisation des nouvelles technologies dans la mesure des réseaux sociaux

1] Enregistrer les positions d’une multitude d’individus

1.1] Vidéo 3D

1.2] Radar

2] Enregistrer les interactions entre individus

2.1] Enregistreurs de proximité

2.2] Puces RFID

2.3] Caméras embarquées

2.4] Enregistreurs de plongée

3] Manipuler les interactions entre individus

3.1] Robots

3.2] Chirurgie/lésion

4] Les méthodes d’analyses

Chapitre 4 (page 119), Raphaël Jeanson, Daniel Charbonneau, Alessandro Cini, Cristian Pasquaretta, Réseaux d’interactions chez les insectes

1] Méthodologie

2] Réseaux sociaux chez les fourmis

3] Réseaux chez les guêpes

4] Réseaux sociaux chez la drosophile

5] Réseaux épidémiologiques

6] Conclusion

Chapitre 5 (page 137), Johann Mourier & Serge Planes, Réseaux sociaux chez les poissons

1] Méthodologie

1.1] Techniques de marquage et identification des individus

1.2] Acquisition des données

2] Intérêt des réseaux sociaux dans l’étude des poissons

2.1] Structure de population et organisation sociale

2.2] Familiarité et fidélité à un site

2.3] Coopération et décisions collectives

3] Directions futures

3.1] Étendre l’utilisation des réseaux sociaux à une plus grande diversité taxonomique

3.2] Structure génétique et rôle de l’apparentement dans les réseaux sociaux chez les poissons

3.3] Utiliser la théorie des réseaux sociaux pour comprendre les mécanismes des agrégations à grande échelle

Chapitre 6 (page 161), Palmyre Boucherie, Mylène Mariette, Margaux Rat, Philipp Heeb, Claire Doutrelant, Christophe Bousquet, Application de l’analyse des réseaux sociaux chez les oiseaux

1] Couples et jeunes  : caractérisation de l’organisation sociale de l’espèce

1.1] Soins parentaux et reproduction communautaire

1.2] Apport des réseaux sociaux pour l’étude du choix du partenaire  : où et comment  ?

1.3] Copulations hors couple et séparations  : ce que les réseaux sociaux pourraient nous apprendre

2] Relations hors couple  : stratégies individuelles au sein des systèmes sociaux

2.1] Relations sociales hors couple

2.2] Structure sociale chez les espèces coloniales  : analyse de la diversité des associations

2.3] Relations intrasexe et succès d’appariement des individus

2.4] Apport des réseaux sociaux pour l’étude des hiérarchies de dominance

2.5] Influence de la personnalité sur le réseau

2.6] Relations interspécifiques

3] Fonctionnalité des réseaux chez les oiseaux

3.1] Influence du réseau sur les mouvements collectifs

3.2] Influence du réseau sur la transmission d’information et de parasites

3.3] Dynamiques de fission-fusion

3.4] Application de la théorie des réseaux à l’étude des chants

4] Conclusion

Chapitre 7 (page 205), Nicolas Perony, Cédric Sueur & Gerald Kerth, La socialité complexe des chauves-souris

1] Les causes de la socialité des chauves-souris

2] Les conséquences de la socialité

3] Quelles implications pour la socialité animale en général  ?

4] Conclusions

Chapitre 8 (page 233), Marie-Hélène Pillot, Rémy Cazabet & Frédéric Amblard, Les ongulés

1] Vie en groupe

2] Dynamique de cohésion des groupes

2.1] Facteurs d’agrégation  : les types de groupes et les proximités intragroupes

2.2] Des associations intergroupes  : communautés

2.3] Les populations structurées en unités socio-spatiales

3] Analyse d’un réseau d’isards

3.1] Objectifs

3.2] Matériels et méthodes

3.2.1] Description de l’espèce

3.2.2] Jeu de données

3.2.3] Périodes hivernales et estivales

3.3] Détection des réseaux chez les isards

3.3.1] Transformation des données de co-observations en un réseau temporel

3.4] Avantages et inconvénients de la méthode

3.5] Interprétation des résultats

3.5.1] Communautés obtenues

3.5.2] Détail de l’évolution temporelle d’une communauté

3.5.3] Perméabilité des communautés

4] Conclusion

Chapitre 9 (page 261), Julie Duboscq, Céline Bret & Sebastian Sosa, Primates non humains

1] Caractéristiques individuelles et réseau social

2] Décisions collectives, transmission d’information et réseaux

3] Affinités sociales, coopération et réseaux

4] Évolution des sociétés et réseaux

5] Conclusion

Chapitre 10 (page 291), Mélanie Roy & Marc-André Selosse, Les réseaux mycorhiziens, des réseaux mutualistes entre champignons et racines des plantes

1] Les mycorhizes  : une interaction champignon(s)-plante(s)  ?

1.1] Des associations mutualistes

1.2] Des associations mutualistes diffuses, multiples et variables

1.3] Des préférences plutôt qu’une spécialisation  ?

2] Les champignons  : des réseaux par nature

2.1] Qui sont ceux qui tissent ces réseaux sous nos pieds  ?

2.2] Des hyphes aux réseaux

2.3] Au-delà de la racine, le sol et d’autres racines, encore

3] Nature, intensité et direction des flux dans les réseaux mycorhiziens

3.1] Des flux d’eau, de sels minéraux… et de matière organique  !

3.2] Les mycohétérotrophes et la dépendance au réseau

3.3] Intensité et variabilité spatio-temporelle des flux chez les mixotrophes

3.4] (Bi)directionnalité des flux

3.5] Des flux, dans tous les réseaux  ?

4] Importance des réseaux mycorhiziens à l’échelle des écosystèmes

4.1] Partage des mycorhizes et plantes nourrices

4.2] Communication inter-plantes et protection vis-à-vis des herbivores

4.3] Stabilité et dynamique

4.4] Structure des assemblages et comparaison des réseaux écologiques

5] Conclusion

Chapitre 11 (page 329), David Vogel, Les réseaux chez les myxomycètes

1] Méthodologie

2] Réseaux formés entre sources de nourriture

2.1] Entre deux sources de nourriture

2.2] Entre trois sources de nourriture

2.3] Entre de multiples sources de nourriture

2.4] Modélisation mathématique

3] Réseaux formés entre plasmodes

4] Conclusion

Chapitre 12 (page 343), Julie Duboscq & Philipp Heeb, Pathogènes, parasites et réseaux dans les sociétés animales

1] Rôle du réseau social sur les transmissions de pathogènes

2] Effets des pathogènes sur les réseaux sociaux

3] Transmission de pathogènes et systèmes d’appariement

Chapitre 13 (page 359), Johann Mourier & Serge Planes, Structure des réseaux sociaux et diversité génétique

1] Mesures de génétique couramment utilisés

1.1] Coefficient d’apparentement (relatedness)

1.2] ADN mitochondrial et diversité haplotypique

1.3] Génétique quantitative

2] Diversité génétique dans les sociétés animales

2.1] Facteurs influençant la diversité génétique au sein des groupes sociaux

2.2] Méthodes employées pour explorer les liens entre structure des réseaux et diversité génétique

3] Application des réseaux sociaux combinés à la génétique dans les sociétés animales

3.1] Primates

3.2] Autres mammifères terrestres

3.3] Mammifères marins

3.4] Pinnipèdes

3.5] Oiseaux

3.6] Reptiles

3.7] Poissons

3.8] Invertébrés

3.9] Synthèse

4] Directions futures

4.1] Vers une meilleure exploitation des réseaux sociaux dans des sociétés hiérarchisées

4.2] Vers une meilleure intégration des modèles de génétique quantitative

4.3] Déterminer les gènes régulant le comportement social

4.4] Effet de la transmission culturelle sur la diversité génétique

4.5] Réseaux génétiques

Chapitre 14 (page 407), David Charbonneau, Sebastian Sosa, Cristian Pasquaretta, Jean-Loup Guillaume, L’étude de l’émergence, de l’organisation et de l’évolution des structures de réseau par l’analyse de réseaux dynamiques

Introduction] Réseaux et réseaux temporels

1] Que savons-nous des réseaux temporels  ?

1.1] Types de questions auxquelles on peut répondre

1.2] Revue des modèles utilisés

2] Réseaux dynamiques appliqués aux systèmes biologiques

2.1] Réseaux sociaux dynamiques

2.2] Directions futures  : réseaux dynamiques et communautés

3] Conclusion

Chapitre 15 (page 423), Cédric Sueur, Nicolas Perony, Frédéric Amblard, Jean-Loup Guillaume, Modélisation des réseaux sociaux

1] Comprendre la complexité

2] Les systèmes multi-agents

3] Les avantages de la modélisation des réseaux sociaux et les pièges potentiels

4] Les réseaux sociaux comme paramètres fonctionnels du modèle

5] Les réseaux sociaux comme paramètres d’étude du modèle

6] Considérations pratiques pour la modélisation des réseaux sociaux

7] Quelques exemples de modèles de réseaux

8] Limites de la modélisation

9] Discussion et perspectives

Chapitre 16 (page 445), Cédric Sueur & Marie Pelé, Utilisation de l’analyse des réseaux sociaux dans la gestion des animaux maintenus en captivité

1] Comprendre et analyser le comportement social des populations captives

2] Utiliser l’analyse des réseaux sociaux comme proxy du bien-être animal

3] Gérer les programmes de reproduction

4] Manipuler les groupes

5] Déterminer l’utilisation des ressources dans l’enclos

6] Prévenir la transmission des maladies

7] Conclusions

Chapitre 17 (page 469), Cédric Sueur, Fonction et évolution des réseaux sociaux

1] Rôle fonctionnel du réseau dans l’adaptation des individus à leur environnement

2] Réseau et partage d’information

3] Réseau et transmission des pathogènes

4] Compromis entre transmission de l’information et transmission des pathogènes

5] Sélection des réseaux

6] Rôle de l’auto-organisation

7] Action combinée de la sélection et de l’auto-organisation

Les auteurs/Les résumés (page 487)

Voir la page Facebook du livre

Recension dans Natures Sciences Sociétés, n° 24, 2016 (p. 293-294).